七股潟湖是陸上魚塭與七股海域的緩衝水域，由於潟湖所養殖的貝類，可濾食浮游生物及其他有機的物質，所以可提供良好水質的海水給魚塭使用，並且可淨化魚塭所排放出來優養化的池水，使七股外海的海水保持潔淨。

         依據1993年漁業年報的統計，台南縣的淺海養殖面積為2,831公頃，約佔全台灣的17％，而七股鄉的淺海養殖面積即有983公頃，佔台南縣的42％；在養殖魚塭方面，台南縣的鹹水魚塭面積為7,285公頃，佔全台灣的28％，淡水漁塭面積為5,903公頃，佔全台灣的24％，而七股鄉的養殖魚塭約有七千公頃，其中鹹水魚塭的面積則有六千多公頃，約佔台南縣的82％，由這些數據可以看出七股鄉在台南縣的水產養殖事業中所佔的地位；此外，依據中央研究院動物研究所邵廣昭教授等自1994年8月起，至1996年7月止，在西寮溪口、七股溪口、曾文溪口、鹿耳門溪口與四草紅樹林區等五個採樣地點，所採獲的魚種數量，由北到南分別為西寮溪口有176種、七股溪口有95種、曾文溪口有97種、鹿耳門溪口有133種、四草有90種（表1-5）；其中，屬於經濟性的魚種就有52科172種，佔魚總種數的66.4％，包括以白鰻、烏魚、虱目魚、銀紋笛鯛、黃鰭鯛、黑鯛、黃鍚鯛、花身雞魚等八種台灣重要的水產養殖魚種，以及托爾逆鉤、鱸滑石斑、竹針金梭魚、尖吻鱸、星雞魚、四指馬鱍魚、點籃子魚、褐點籃子魚、皮氏叫姑魚、沙、曳絲鑽嘴魚等高經濟性價值的魚種。單就其中的黑鯛魚苗一項，依據海洋大學張峰榮先生的研究顯示：1994年七股地區所繁殖、實際銷售的黑鯛魚寸苗數量約為1,617萬尾，佔全台灣黑鯛魚苗來源的一半以上。

         這些資料顯示七股沿海地帶已成為一些底棲、洄游、降海、溯河性魚類的棲息與作為通道的場所，更是沿海漁業資源仔稚魚的重要哺育場所。如果，濱南工業區開發後，潟湖被填了土，其所具有的水質淨化功能將消失，加上水域的被縮小，魚塭排放水與海水無法充份交換，魚塭池水在惡性循環下必然越來越優氧化，如此一來環繞潟湖四周的六千多公頃的鹹水魚塭將因水質的惡化，發生經營困難，連同原本就在潟湖養蚵、施放定置魚網，以及在曾文溪口到八掌溪口沿海漁場捕魚的青鯤鯓、龍山、西寮、三股、十份、海寮、馬沙溝、蘆竹溝、北門等村落超過16,000位漁民的生計，都將因潟湖功能的喪失與沿海漁場的遭到破壞，發生困難！