「台南科學工業園區」的設置緣起於1990年10月，國科會正式提報建議行政院設置第二科學工業園區。這項建議列入1991年提出的《國家建設六年計畫》。

        1993年2月25日，國科會完成設置第二科學工業園區可行性研究，後經區位評選委員會三次會議，台南縣新市基地獲得推薦，1995年2月23日經行政府同意，台南縣新市基地正式成為南部科學工業園區區址。

        1996年1月20日，台南科學工業園區動土，台積電等8家廠商當場簽署投資意願書。3月1日起接受廠商入區申請。

        歷經多年的努力，廠商陸續進駐，國內外高科技人員也陸續湧入，台南科學工業園區成了台南縣經濟發展的動脈，2005年年營業額超過3,500億，園區就業人口數超過4萬人（不含外勞）。

        為了持續南科的發展，如何形塑一個富有魅力的生活環境，提供海內外科技人優質的居住場所，讓南科人根留台南縣，已成為台南縣科技產業發展的重要課題。這幾年下來，台南縣政府積極的推動了幾項令人印象深刻的計畫：

• 台南科學園區特定區開發招商計畫：提出全國首創的「浮動分區」的開發概念，以創新、專業及堅毅的執行力，建立高彈性與高效率的開發模式，使得液晶專區僅1.5年、L&M區也只2年即完工，比政府自辦的開發效率要快一倍以上，又不花中央政府一毛錢，至2005年年底已完成254億的建設，成為全國典範。
• 南科液晶電視及產業支援工業區計畫：選定南科特定區內第一期開發區890公頃內約247公頃的土地辦理變更編定，闢建為「南科液晶電視及產業支援工業區」，推動南科光電產業專區的設立，這不僅呼應政府推動的「兩兆雙星」政策，也符合南科園區光電產業建廠需求，加速液晶工業專區的聚落效應。
• 南科康橋計畫：以英國康橋（Cambridge）優雅的水體與水岸綠地作為概念，整合南科特定區排水道、大型生態滯洪池及水體周邊的公園綠地等開放空間，劃設靜態公園，建構園區員工及附近居民的親水空間，提供作為休憩、散步、慢跑等活動用途，打造出科技、人文及休閒特有景觀，讓兼具科技與人文氣息的康橋美景現身於南科。

        在南科的擴充發展下，水從那裡來？濱南案一旦獲准開發，水又從那裡來？依據南科的水源規劃，南科預估最終每日需水量為20餘萬噸，其中，自來水公司同意每日提供9.93萬噸，主要水源為曾文及南化水庫，可滿足園區至2005年底的需求，嘉南農田水利會則同意提供10.9萬噸。而濱南工業區估計每日用水量約20萬噸，水資源局只承諾每日供水8萬噸，且至2006年為止。濱南案不足的水要從那裡來？以南科的經驗來看，當然是移用農業用水，移用的單價是多少？以南科為例：農田水利會希望每噸10元，南科管理局希望降為8元；以後濱南案進來搶水，費用要怎麼算？有那麼多農業用水可以移用嗎？排擠現象的出現，已經毋庸置疑！