為因應九二一震災重建區失依老人、兒童、身心障礙者等弱勢族群或邊遠地區民眾傷病就醫、就學、就業或福利輸送之需要，經2001年2月16日第一屆第七次董監事聯席會核定通過「弱勢族群暨邊遠地區921溫馨巴士補助專案」，補助重建區縣（市）政府購買（或租用）載送弱勢族群與提供服務所需交通工具，以及提供服務所需之管理費用三年。

        基於重建區縣（市）政府需求與運作方式不同，「弱勢族群暨邊遠地區921溫馨巴士補助專案」實施初期原本擬採取由縣（市）政府提報需求與實施計畫之方式辦理，惟部分縣（市）政府對於補助案之認知與需求數量差異相當大，經溝通無效後，再經2001年8月31日第一屆第十次董監事聯席會同意將實施方式調整為「由縣（市）政府於核定補助款額度內，自行評估實際需要，調配補助款之使用方式，並以合理、有效運用民間捐款為原則，自行擬定實施計畫，據以實施與考核」。